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Stellenangebote

PhD student „Computational biology of ctDNA“ (m/f/d)

We are looking for committed people with enthusiasm for biomedical research!

TRON gGmbH – Translational Oncology at the Medical Center of the University Mainz – is a non-university, biopharmaceutical research institute in the legal form of a non-profit organization. The company’s aim is to develop highly innovative technologies to address medical needs in the fields of cancer diagnostics and therapeutics. TRON was founded in Mainz in 2010 and works in close cooperation with universities and clinics as well as with regional, national and international research institutions and companies in the pharmaceutical industry.

As part of our team, you have the opportunity to work with talented and dedicated colleagues, to develop and expand your professional experience, and to be at the cutting-edge of translational science to improve patient lives.

TRON is currently expanding its multidisciplinary Computational Medicine Unit with exceptional experience in next generation sequencing data analysis and immuno-informatics. One of our projects focuses on circulating tumor DNA (ctDNA). CtDNA is fragmented DNA derived from tumors and circulates in the bloodstream. Analyzing ctDNA enables early cancer detection, molecular profiling, treatment monitoring and to study tumor evolution. A key challenge is the sensitive computational identification of tumor specific mutations from sequencing data of plasma samples. In order to enlarge our technological knowledge and expertise, we are searching for a

PhD student „Computational biology of ctDNA“ (m/f/d)

DUTIES AND RESPONSIBILITIES

·         Design efficient sequencing and analysis strategies for ctDNA

·         Implement best-in-class software solutions for highly accurate data analysis

·         Design experiments for confirmation of computed findings

·         Analyze time series data from clinical studies

·         Tight interaction with genomics and molecular biology teams

QUALIFICATION AND EXPERIENCE

·         Master-level education in bioinformatics, computer science or a related field

·         Deep understanding of cancer biology and immunology is a plus

Any experience in NGS data analysis and programming as well as in in machine learning completes your profile.

If you are a self-starter who loves working effectively in an agile start-up environment, and besides if you do have strong visual, verbal and written communication skills, you will feel well and home at TRON and within your task. If you are additionally an enthusiastic team player who is thrilled by supporting the implementation of personalized medicine, you should not wait any longer to apply for this position.

We look forward to receiving your application.

Please send your application documents (cover letter, CV, certificates) in one document of max. 5 MB by email to Diese E-Mail-Adresse ist vor Spambots geschützt! Zur Anzeige muss JavaScript eingeschaltet sein! to the attention of Sandra Nauth, reference “PhD ctDNA”.

For further information please visit our homepage www.tron-mainz.de

W1 professor with tenure track to W2 for multi-dimensional omics analysis

The Faculty of Technology at Bielefeld University, Germany, working in cooperation with the Leibniz-Institut für Analytische Wissenschaften (ISAS) would like to appoint a

 

W1 professor with tenure track to W2 for multi-dimensional omics analysis

 

to start at the earliest possible opportunity.

 

On appointment as a university professor, the successful applicant is to be granted leave in order to take on the professional duties of a leader of the working group "Data analysis and visualisation" at the Leibniz-Institut für Analytische Wissenschaften – ISAS – e.V. in Dortmund, Germany (so-called "Jülich model").

To fill this role, we are looking for an outstanding young academic whose main area of research within the context of multi-dimensional omics analysis addresses topics such as the algorithms of data analysis, visualisation or effects analysis. The holder of the position will represent their focal area in both research and in teaching. They will cooperate with the Bioinformatics working group in the Faculty of Technology and will set up a working group at ISAS in Dortmund. The goal of ISAS is to develop analytical procedures, methods and instruments for precision medicine tailored to the needs of the patient in order to improve the prevention, diagnosis and treatment of disease, thereby making a significant contribution towards meeting the challenges facing society in the fields of medicine and healthcare. To achieve this, ISAS develops efficient measurement strategies and interlinks these with analytical methods on the basis of an integrative multi-method concept for the application in biomedicine and medical research. There are opportunities at Bielefeld University for interdisciplinary and cross-faculty collaboration with establishments such as the Centre for Biotechnology (CeBiTec) and the Bielefeld Institute for Bioinformatics Infrastructure (BIBI).

In line with the "Jülich model", the leave of absence to work at ISAS also involves a teaching commitment of 4 courses. During the junior professor phase, there is an expectation that competitive third-party funds will be procured.

 

In accordance with Section 36 of the Higher Education Act for North Rhine-Westphalia (HG NRW), the prerequisites for the appointment are a completed university degree and PhD in a relevant field (preferably Informatics), as well as pedagogical aptitude.

Applications from suitable persons with a serious disability and disabled persons of equal ability are expressly encouraged.

Bielefeld University has received a number of awards for its successes in terms of equality of opportunity and is certified as a family-friendly university. The university is always delighted to receive applications from women. This is particularly the case in the academic area as well as in technology, IT and in the skilled crafts and trades. Applications are dealt with in accordance with the North Rhine-Westphalia Equality Act.

 

The following documents are to be submitted with the application:

• Cover letter

• CV

• List of publications, with the two most important publications clearly marked

• Two-page research and teaching concept

• List of courses already taught, together with further evidence of suitability as a teacher (e.g. recent assessments, if available)

• An overview of research activities carried out and of third-party funds acquired to date, if available

• Copies of academic certificates

 

Please submit your application in either German or English by 18 January 2021 at the latest

online via the Bielefeld University appointments portal: https://berufungen.uni-bielefeld.de

 

Contact:

Bielefeld University

Dean of the Faculty of Technology PO Box 10 01 31

33501 Bielefeld

E-mail: Diese E-Mail-Adresse ist vor Spambots geschützt! Zur Anzeige muss JavaScript eingeschaltet sein!

 

Please be aware that we cannot exclude the possibility of confidentiality being compromised or of a third-party gaining unauthorised access to information if unencrypted e-mail is used for communications. You can find information on the way we process personal data at http://www.uni-bielefeld.de/Universitaet/Aktuelles/Stellenausschreibungen/2019_DS-Hinweise.pdf.

W1-Professur mit Tenure Track nach W2 für mehrdimensionale Omics-Analysen

An der Technischen Fakultät der Universität Bielefeld ist

in Kooperation mit dem Leibniz-Institut für Analytische

Wissenschaften (ISAS) zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine

 

W1-Professur mit Tenure Track

nach W2 für mehrdimensionale

Omics-Analysen

 

zu besetzen.

 

Die*der erfolgreiche Bewerber*in soll mit der Ernennung

zur*zum Universitätsprofessor*in beurlaubt werden, um die

Dienstgeschäfte einer*eines Leiterin*Leiters der Arbeitsgruppe

„Datenanalyse und Visualisierung“ am Leibniz-Institut für

Analytische Wissenschaften – ISAS – e.V. in Dortmund

wahrzunehmen (sog. „Jülicher Modell“).

 

Hierfür suchen wir eine*n hervorragende*n Nachwuchswissenschaftler*in,

deren bzw. dessen Forschungsschwerpunkt

im Kontext der mehrdimensionalen Omics-Analysen Themenbereiche

wie die Algorithmik der Datenanalyse, Visualisierung

oder Effektanalysen adressiert. Die*der Stelleninhaber*in

vertritt den Bereich in Forschung und Lehre. Sie/er kooperiert

mit den bioinformatischen Arbeitsgruppen der Technischen

Fakultät und baut eine Arbeitsgruppe im ISAS am Standort

Dortmund auf. Ziel des ISAS ist die Entwicklung analytischer

Verfahren, Methoden und Instrumente für eine auf den

Patienten zugeschnittene Präzisionsmedizin, um die

Prävention, Diagnostik und Therapie von Erkrankungen

zu verbessern und damit einen signifikanten Beitrag zur

Bewältigung der gesellschaftlichen Herausforderungen im

Bereich der Gesundheitsvorsorge und Medizin zu leisten.

Um dies zu erreichen, entwickelt das ISAS effiziente Messstrategien

und verzahnt analytische Methoden auf Basis eines

integrativen Multimethodenkonzeptes für den Einsatz in der

Biomedizin und Gesundheitsforschung. An der Universität

Bielefeld bestehen Möglichkeiten der interdisziplinären und

fakultätsübergreifenden Mitarbeit in Einrichtungen wie dem

Centrum für Biotechnologie (CeBiTec) und dem Bielefelder

Institut für Bioinformatik-Infrastruktur (BIBI).

 

Entsprechend dem „Jülicher Modell“ wird mit der Beurlaubung

an das ISAS eine Lehrverpflichtung von 4 LVS verbunden.

Während der Juniorprofessur-Phase wird die Einwerbung

kompetitiver Drittmittel erwartet.

 

Einstellungsvoraussetzungen sind gemäß § 36 HG NRW ein

abgeschlossenes Hochschulstudium und Promotion in einem

relevanten Gebiet (vorzugsweise Informatik) sowie die

pädagogische Eignung.

 

Für die Bewerbung sind folgende Dokumente einzureichen:

• Anschreiben

• Lebenslauf

• Verzeichnis der Veröffentlichungen und die Kennzeichnung

der zwei wichtigsten Publikationen

• Zweiseitiges Forschungs- und Lehrkonzept

• Verzeichnis der durchgeführten Lehrveranstaltungen sowie

sonstige Nachweise der Lehrqualifikation (z. B. aktuelle

Evaluierungen, falls vorhanden)

• Eine Aufstellung der Forschungsaktivitäten und der bislang

eingeworbenen Drittmittel, falls vorhanden

• Kopien akademischer Zeugnisse

 

Bitte reichen Sie Ihre Bewerbungen in deutscher oder englischer

Sprache bis zum 18. Januar 2021 online über das Berufungsportal

der Universität Bielefeld ein:

https://berufungen.uni-bielefeld.de

 

Kontakt:

Universität Bielefeld

Dekan der Technischen Fakultät

Postfach 10 01 31 • 33501 Bielefeld

E-Mail: Diese E-Mail-Adresse ist vor Spambots geschützt! Zur Anzeige muss JavaScript eingeschaltet sein!

 

Bitte beachten Sie, dass Gefährdungen der Vertraulichkeit und

der unbefugte Zugriff Dritter bei einer Kommunikation per

unverschlüsselter E-Mail nicht ausgeschlossen werden können.

Informationen zur Verarbeitung von personenbezogenen

Daten finden Sie unter

http://www.uni-bielefeld.de/Universitaet/Aktuelles/

Stellenausschreibungen/2019_DS-Hinweise.pdf.

Bioinformatician (m/f/d) to work on genome assembly, genome annotation and comparison [LOEWE-TBG]

The LOEWE Center for Translational Biodiversity Genomics (LOEWE-TBG, https://tbg.senckenberg.de/) aims at making the genomic basis of biological diversity accessible for basic and applied research. Building on genome sequencing and analysis, LOEWE-TBG research topics range from comparative genomics, natural products genomics, and genomic biomonitoring to functional environmental genomics. LOEWE-TBG is based in Frankfurt am Main, Germany, and is a joint venture of the Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung (SGN), Goethe-University Frankfurt, Justus-Liebig-University Giessen and Fraunhofer Institute for Molecular Biology and Applied Ecology.

The LOEWE-TBG in Frankfurt am Main invites applications for a
Bioinformatician (m/f/d) to work on genome assembly, genome annotation and comparison (full time)
 
Your tasks
• Developing, maintaining and automating computational pipelines for genome assembly and annotation of diverse eukaryotic species that are sequenced at TBG using state-of-the-art sequencing technologies and compute infrastructure,
• Communication and collaboration with TBG and other researchers working on various genomic projects.
Your profile
• excellent programming skills in a Linux environment as well as experience with shell scripting and Unix tools,
• previous experience in genomics, genome assembly and/or annotation,
• PhD degree in bioinformatics / computational biology, genomics or a related area is an advantage but not strictly required.
What is awaiting you?
• Joining a dynamic team of interdisciplinary researchers at an international research institution,
• Exciting research in a fast-growing research field,
• Flexible working hours – annual special payment – company pension scheme – Senckenberg badge for free entry in museums in Frankfurt, the zoo, botanical garden and Palmengarten – leave of 30 days/year – a job ticket subsidy for public transport.

Place of employment: Frankfurt am Main
Working hours: full time (40 hours/week)
Type of contract: initially limited
Salary: according to the collective agreement of the State of Hesse (pay grade E 13)

The contract is initially limited and should start as soon as possible. The employer is the Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung who supports equal opportunity of men and women and therefore strongly invites women to apply. Equally qualified handicapped applicants will be given preference.

How to apply
Please send your application, mentioning the reference of this job offer (ref. #12-20027) by e-mail and include a cover letter detailing your research interests and experience, a detailed CV and copies of your certificates, transcripts and grades to:

Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung
Senckenberganlage 25
60325 Frankfurt a.M.
E-Mail: Diese E-Mail-Adresse ist vor Spambots geschützt! Zur Anzeige muss JavaScript eingeschaltet sein!

The application deadline is January 10th, 2021, the search will continue until this position has been filled.

Bioinformatician (m/f/d) to work on genome assembly, genome annotation and comparison

Job Announcement ref. #12-20027

 

The LOEWE Center for Translational Biodiversity Genomics (LOEWE-TBG, https://tbg.senckenberg.de/) aims at making the genomic basis of biological diversity accessible for basic and applied research. Building on genome sequencing and analysis, LOEWE-TBG research topics range from comparative genomics, natural products genomics, and genomic biomonitoring to functional environmental genomics. LOEWE-TBG is based in Frankfurt am Main, Germany, and is a joint venture of the Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung (SGN), Goethe-University Frankfurt, Justus-Liebig-University Giessen and Fraunhofer Institute for Molecular Biology and Applied Ecology.

 

 

 

The LOEWE-TBG in Frankfurt am Main invites applications for a

 

 

 

Bioinformatician (m/f/d) to work on genome assembly, genome annotation and comparison

 

(full time)

 

 

 

Your tasks

 

·         Developing, maintaining and automating computational pipelines for genome assembly and annotation of diverse eukaryotic species that are sequenced at TBG using state-of-the-art sequencing technologies and compute infrastructure,

 

·         Communication and collaboration with TBG and other researchers working on various genomic projects.

 

Your profile

 

·         excellent programming skills in a Linux environment as well as experience with shell scripting and Unix tools,

 

·         previous experience in genomics, genome assembly and/or annotation,

 

·         PhD degree in bioinformatics / computational biology, genomics or a related area is an advantage but not strictly required.

 

What is awaiting you?

 

·           Joining a dynamic team of interdisciplinary researchers at an international research institution,

 

·           Exciting research in a fast-growing research field,

 

·           Flexible working hours – annual special payment – company pension scheme – Senckenberg badge for free entry in museums in Frankfurt, the zoo, botanical garden and Palmengarten – leave of 30 days/year – a job ticket subsidy for public transport.

 

Place of employment:  Frankfurt am Main

 

Working hours:           full time (40 hours/week)

 

Type of contract:          initially limited

 

Salary:                          according to the collective agreement of the State of Hesse (pay grade E 13)

 

The contract is initially limited and should start as soon as possible. The employer is the Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung who supports equal opportunity of men and women and therefore strongly invites women to apply. Equally qualified handicapped applicants will be given preference.

 

How to apply

 

Please send your application, mentioning the reference of this job offer (ref. #12-20027) by e-mail and include a cover letter detailing your research interests and experience, a detailed CV and copies of your certificates, transcripts and grades to:

 

 

 

Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung

 

Senckenberganlage 25

 

60325 Frankfurt a.M.

 

E-Mail: Diese E-Mail-Adresse ist vor Spambots geschützt! Zur Anzeige muss JavaScript eingeschaltet sein!

 

The application deadline is January 10th, 2021, the search will continue until this position has been filled.  

 

For more information please contact Prof. Dr. Michael Hiller, Diese E-Mail-Adresse ist vor Spambots geschützt! Zur Anzeige muss JavaScript eingeschaltet sein!.


Links: https://www.senckenberg.de/de/ueber-uns/karriere/wissenschaftler/

Professorship for Data, Sensors and Devices / Digital Transformation

The Faculty of Engineering at Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg (FAU) invites applications for an
 
 

Open Topic Tenure Track Professorship for Data, Sensors and Devices / Digital Transformation (W1 / Assistant Professor)

at the Department of Artificial Intelligence in Biomedical Engineering

 
Candidates should have already developed their own teaching and research profile, particularly in the following areas: We seek to appoint a top early career scientist who will develop outstanding expertise in the field of artificial intelligence in biomedical engineering focusing on data, sensors and devices/digital transformation.
 

The professorship is part of the Federal and State programme for supporting young researchers and is to be filled by the earliest possible starting date for an initial period of three years. Upon successful evaluation, the appointment will be extended for another three years. FAU offers the long-term perspective of a permanent appointment to a W3 professorship if the requirements of the tenure evaluation are met.

  • Human-technology interaction (e.g. intelligent multimodal medical UI, smart scanning support, brain-computer interface, neuromonitoring)
  • Autonomous and intelligent data acquisition (e. g. automated quality assurance, smart examination, scan optimisation)
  • Data integration, representation and visualisation (e. g. knowledge representation, smart research data management/semantic interoperability, process optimisation, process mining)
  • Computational methods for bioinformatics (e. g. artificial intelligence for analytics, -omics, computational neuroscience)
  • Intelligent materials and sensors (e. g. sensory/biosensory materials, intelligent sensing, sensing and analysis of human motion and emotion, lab on a chip for digital diagnostics, neuromorphic circuits)

 
Successful candidates must be willing to collaborate in setting up and teaching a new Bachelor’s and Master’s degree programme in Artificial Intelligence in addition to teaching in existing degree programmes such as Medical Engineering, Medical Process Management and Data Science. The professor will be appointed as a member of the Faculty of Medicine and the Faculty of Engineering.
 
For further information and the application guideline please see
https://www.fau.eu/people/careers-human-resources/professorships/

Please submit your complete application documents (CV, list of publications, list of lectures and courses taught, copies of certificates and degrees, list of third-party funding) online at https://berufungen.fau.de by 24.01.2021, addressed to the President of FAU. Please contact Diese E-Mail-Adresse ist vor Spambots geschützt! Zur Anzeige muss JavaScript eingeschaltet sein! with any questions.

Bioinformatician / R developer in Malaria research

The Swiss Tropical and Public Health Institute (Swiss TPH) is a world-leading institute in global health with a particular focus on low- and middle-income countries. Associated with the University of Basel, Swiss TPH combines research, services, and education and training at the local, national and international level.

Our Department of Epidemiology and Public Health (EPH) is seeking a highly motivated Bioinformatician / R developer with strong technical and analytical skills to work within the Infectious Disease Modelling Unit. In this role, you will help design evidence-based strategic plans by developing and maintaining programs which provide analytical evidence on how countries can reduce their malaria burden.

Our modelling team mainly uses the simulation platform OpenMalaria, which has been developed by Swiss TPH and is maintained by another team. In your role, you will have a key position between modelers and the simulation platform. You will improve, standardize and maintain workflows of how modelers should use the core platform. You will design, implement and teach code development methods, and provide technical support to the team. Your initiative and creativity shape the way we work and will be a valuable component to boost team productivity and enhance production readiness. A strong technical aptitude is essential.

Responsibilities:
Technical:

  • Design and implement R functions to improve, standardize and maintain the workflow, which our modelers depend on to simulate the transmission and burden of malaria in various endemic countries

  • Collaborate with modelers to define functional needs and implement new features for the analysis workflow

  • ntegrate and maintain these functions in R packages according to best coding practices (CI/CD, testing etc.) to standardize analyses and workflows

  • Train and support team members and partners on the workflow and developed packages

  • Develop and maintain strong working relationships with developers of the main simulation platform


Analytical:

  • Calibrate mathematical malaria transmission models and conduct simulations of the impact of malaria transmission and burden for national and sub-national analyses in multiple high-burden countries

  • Provide support to infectious disease modelers and epidemiologists for their research, analyses and other needs towards project deliverables


Skills and qualifications:

  • Master’s degree in a relevant technical discipline, such as Bioinformatics, Computer Science, Statistics, Informatics or 3+ years of experience in a relevant role

  • Proficiency in R with demonstrated experience of writing R packages

  • Strong interest in applying computational approaches to support epidemiological questions

  • Hands-on experience with conducting and analysing computer simulations

  • Previous experience with Geospatial modelling and Machine Learning would be beneficial

  • Ability to work in teams, adapt to new challenges and operate as part of a multi-cultural team

  • Experience working in fast-paced, output-oriented environments

  • Excellent written and oral communication skills in English


Knowledge of the following software is required:
Unix, Git

Knowledge of the following software / packages would be beneficial
C++, testthat / runit, devtools, Gitlab CICD / Travis CI, roxygen2, renv / packrat, Python, Windows 10

Please note that we can only accept applications via our online recruiting tool:
https://recruitingapp-2698.umantis.com/Jobs/All

Entwickler*in im Bereich Datenbanken (Teilzeit 75%)

Die Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung (SGN) wurde 1817 gegründet und zählt zu den wichtigsten Forschungseinrichtungen rund um die biologische Vielfalt. An den elf Standorten in ganz Deutschland betreiben Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler aus über 40 Nationen modernste Forschung auf internationaler Ebene.
 
 
 
Die Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung und das LOEWE-Zentrum für Translationale Biodiversitätsgenomik suchen zur Verstärkung unseres Entwicklungsteams für Biodiversitätsdatenbanken ab sofort am Standort Frankfurt eine*n
 

Entwickler*in im Bereich Datenbanken

(Teilzeit, 75%)

 
 
Das sind Ihre Herausforderungen
 
Unser Team entwickelt die Informationsarchitektur für Erschliessung, Darstellung und Analyse unserer biologischen und geologischen Sammlungen und stellt damit die grundlegende Dateninfrastruktur für Senckenbergs umfangreiche Forschungsprojekte bereit. Aufgabe der Stelle ist die Unterstützung der Entwicklung eines Datenbank-Prototypen für unsere Sammlungsobjekte auf Basis sogenannter Digitaler Objekte (Datencontainer aus Forschungsdaten, Metadaten und dauerhafter Verlinkung), um eine umfangreiche Nachnutzung (www.go-fair.org/fair-principles) unserer Datenbestände in internationalen Datenförderationen - insbesondere im Rahmen der European Open Science Cloud (www.eosc-portal.eu) - auf der Basis offener Standards und Schnittstellen zu ermöglichen.
 
Das erwarten wir
 
  • Studium der Fachrichtung Informatik (Uni/FH), Bioinformatik, (Bio-)Physik oder vergleichbare Qualifikation mit Bezug zur Anwendungsentwicklung
     
  • Interesse, sich in den Themenbereich Digital Object Infrastructures auf Basis des Frameworks Cordra (www.cordra.org) einzuarbeiten
     
  • gute Kenntnisse in der Entwicklung web-basierter Software insbesondere im Bereich Verlinkung, Indexierung und Prozessierung von Forschungsdaten
     
  • Kenntnisse in der Programmierung in Java und/oder Python sowie vorzugsweise Erfahrung mit entsprechenden Web-bezogenen Frameworks wie Flask
     
  • Kenntnisse und praktische Erfahrung mit RDBMS (z.B. PostgreSQL) und optimalerweise NoSQL Datenbanken (z.B. MongoDB)
     
  • hohe Bereitschaft und Motivation, sich kontinuierlich in aktuelle Technologien einzuarbeiten (z.B. gRPC, JSON-LD sowie Suchtechnologien wie Elasticsearch)
     
  • eine teamorientierte, engagierte und flexible Arbeitsweise
     
 
Wir bieten Ihnen
 
  • eine attraktive und herausfordernde Tätigkeit in einer weltweit anerkannten Forschungseinrichtung
     
  • selbstständiges Handeln in einem internationalen, motivierten und professionellen Umfeld
     
  • Flexible Arbeitszeiten - ein vergünstigtes Jobticket - Unterstützung bei Kinderbetreuung oder bei der Pflege von Familienangehörigen (zertifiziert durch das „audit berufundfamilie“) - Dienstausweis in Verbindung mit kostenfreiem Eintritt in zahlreiche städtischen Museen - Jahressonderzahlung - betriebliche Altersvorsorge - tariflicher Urlaubsanspruch
     
Ort: Frankfurt am Main
 
Beschäftigungsumfang: Teilzeit 75 % (30 Stunden/Woche)
 
Vertragsart: zunächst befristet für 1 Jahr (eine längerfristige Perspektive sowie Aufstockung der Stelle hängt von der Verfügbarkeit etwaiger Mittel ab)
 
Vergütung: nach TV-H (voraussichtliche Entgeltgruppe E 11)
 
Senckenberg strebt an, den Frauenanteil zu erhöhen. Qualifizierte Kandidatinnen werden daher besonders ermutigt, sich zu bewerben. Schwerbehinderte Menschen werden bei gleicher Eignung besonders berücksichtigt. Senckenberg ist durch das „audit berufundfamilie“ zertifiziert.
 
Sie möchten sich bewerben?
 
Dann senden Sie Ihre vollständigen und aussagekräftigen Bewerbungsunterlagen (Motivationsschreiben, Lebenslauf, Ausbildungs- und Arbeitszeugnisse) in elektronischer Form (als eine zusammenhängende PDF-Datei) bitte unter Angabe der Referenznummer #11-20024 bis zum 17.01.2021 an Diese E-Mail-Adresse ist vor Spambots geschützt! Zur Anzeige muss JavaScript eingeschaltet sein! oder bewerben Sie sich direkt auf unserer Homepage über das Online Bewerbungsformular.
 
 
Link: https://www.senckenberg.de/de/ueber-uns/karriere/wissenschaftler/#content-0003_7

Linux System Administrator*in mit Schwerpunkt Scientific Computing [Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung]

Die Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung (SGN) wurde 1817 gegründet und zählt zu den wichtigsten Forschungseinrichtungen rund um die biologische Vielfalt. An den elf Standorten in ganz Deutschland betreiben Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler aus über 40 Nationen modernste Forschung auf internationaler Ebene.

 

Die Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung und das LOEWE-Zentrum für Translationale Biodiversitätsgenomik suchen zum schnellstmöglichen Zeitpunkt am Standort Frankfurt eine*n

 

 Linux System Administrator*in mit Schwerpunkt Scientific Computing

 

(Vollzeit)

 

 Das sind Ihre Herausforderungen

 

·     Planung und Pflege der wissenschaftlichen IT-Infrastruktur, insb. für die Bioinformatik und wissenschaftliche Datenbanken

 

·     Management der Plattformen (Linuxcluster) für wissenschaftliche Simulationen und Analysen

 

·     selbständige Planung und Pflege von Hard- und Softwarekomponenten für die mittel- und langfristige Archivierung von Forschungsdaten

 

·     Unterstützung der Nutzer*innen insb. aus den Bereichen Bioinformatik, Ökologie und Modellierung, wesentliche Verantwortlichkeiten sind u. a. die Installation und Konfiguration grundlegender Softwarekomponenten in enger Kooperation mit den Nutzer*innen im gesamten Lifecycle wissenschaftlicher Primärdaten (Acquisition, Kuration, Pre-/Post-Processing, Analyse) sowie das Management von Services für Data Sharing & Interoperability im Rahmen von Kooperationsprojekten

 

·     Unterstützung der Leitung bei der strategischen Entwicklung der wissenschaftlichen IT sowie bei der Beantragung von Drittmittelprojekten im Bereich Research Data Management und Forschungsdatenrepositorien

 

·     Beteiligung an wissenschaftlichen Projekten mit starkem IT-, Datenbanken-, oder Modellierungsbezug sowie Publikation der Forschungsergebnisse in internationalen Fachzeitschriften

 

Idealerweise verfügen Sie über

 

·     ein abgeschlossenes Studium – gerne auch mit Promotion - im Bereich Informatik, Mathematik, einem verwandten Studiengang oder einer Ausbildung zum/zur Fachinformatiker*in für Systemintegration

 

·     sehr gute Linux-Kenntnisse, bevorzugt im Kontext HPC/Mehrprozessorsysteme

 

·     gute Kenntnisse im Bereich Software Building & Deploying (z. B. make, cmake, maven)

 

·     gute Kenntnisse mit den üblichen Aufgaben der Systemadministration wie Einrichtung von Nutzerkonten, Verwaltung von Zugriffsrechten und Verzeichnisdiensten

 

·     Erfahrung in den Scriptsprachen (z. B. Python, Bash)

 

·     Erfahrung in der Inbetriebnahme von Soft- und Hardware Komponenten, z. B. der Einbindung von Storage-/Filesystemen (z. B. NFS) 

 

·     Erfahrung mit Versionskontrollsystemen (z. B. Git)

 

·     Kenntnisse im Bereich Monitoringsysteme (z. B. Nagios, Ganglia), Software Container (z. B. Docker) sowie Research Data Management und Forschungsdatenrepositorien

 

·     Berufserfahrung im Bereich der Biodiversitäts- und Umweltforschung

 

 Wir bieten Ihnen

 

·  eine attraktive und herausfordernde Tätigkeit in einer weltweit anerkannten Forschungseinrichtung

 

·       selbstständiges Handeln in einem internationalen, motivierten und professionellen Umfeld

 

·       Flexible Arbeitszeiten - ein vergünstigtes Jobticket - Unterstützung bei Kinderbetreuung oder bei der Pflege von Familienangehörigen (zertifiziert durch das „audit berufundfamilie“) - Dienstausweis in Verbindung mit kostenfreiem Eintritt in zahlreiche städtischen Museen - Jahressonderzahlung - betriebliche Altersvorsorge - tariflicher Urlaubsanspruch

 

 

 

 

 

Ort:                                         Frankfurt am Main

 

Beschäftigungsumfang:     Vollzeit (40 Stunden/Woche)

 

Vertragsart:                          zunächst befristet für 2 Jahre

 

Vergütung:                            nach TV-H (voraussichtliche Entgeltgruppe E 11 - 13)

 

 

 

Senckenberg strebt an, den Frauenanteil zu erhöhen. Qualifizierte Kandidatinnen werden daher besonders ermutigt, sich zu bewerben. Schwerbehinderte Menschen werden bei gleicher Eignung besonders berücksichtigt. Senckenberg ist durch das „audit berufundfamilie“ zertifiziert.

 

 Sie möchten sich bewerben?

Dann senden Sie Ihre vollständigen und aussagekräftigen Bewerbungsunterlagen (Motivationsschreiben, Lebenslauf, Ausbildungs- und Arbeitszeugnisse) in elektronischer Form (als eine zusammenhängende PDF-Datei) bitte unter Angabe der Referenznummer #11-20025 bis zum 20.01.2021 an Diese E-Mail-Adresse ist vor Spambots geschützt! Zur Anzeige muss JavaScript eingeschaltet sein! oder bewerben Sie sich direkt auf unserer Homepage über das Online Bewerbungsformular.

Links: https://www.senckenberg.de/de/ueber-uns/karriere/fachkraefte/

Principal Investigators in Machine Learning in Biomedicine (f/m/d)

Helmholtz Zentrum München is a research center with the mission to discover personalized medical solutions for the prevention and therapy of environmentally triggered diseases and promote a healthier society in a rapidly changing world.

Our center is launching the Institute of AI for Health – an emerging European hub for applied AI/ML to drive biomedical discovery and build solutions that transform the future of medicine.

 

We invite applications for

Principal Investigators in Machine Learning in Biomedicine (f/m/d) 100377

 

We offer

 

·        a unique opportunity for scientific independence to establish yourself at the forefront of applied machine learning working with singular biomedical data sets

·        a generous start-up package (salary, positions, running costs) at the level of an ERC Starting Grant; positions are limited to five years, with access to the Tenure Option for Early Career Investigators

·        a dynamic, multicultural, interdisciplinary and highly collaborative research environment in Munich, one of the world’s most liveable cities

 

You and your group will be embedded in the vibrant and thriving AI for Health community in Munich including <a href="https://www.ellismunich.ai/" target="_blank"><span style="font-weight: normal;">ELLIS Munich</span></a> (with the opportunity to join the ELLIS society), <a href="https://www.helmholtz.ai/" target="_blank">Helmholtz AI</a>,

      the <a href="https://www.helmholtz-muenchen.de/icb/index.html" target="_blank">Institute of Computational Biology</a>, <a href="https://www.helmholtz-muenchen.de/en/helmholtz-zentrum-muenchen/index.html" target="_blank"> Helmholtz Zentrum München</a>  and the <a href="https://www.pioneercampus.org" target="_blank">Helmholtz Pioneer Campus</a>.

   

Your profile: We encourage innovative PhD’s to put forward their original scientific proposal with a clear pathway to establishing themselves as drivers in the field. An outstanding track-record, a collaborative and entrepreneurial mindset, and first leadership experience puts you in an ideal position to benefit from and nurture our AI for Health environment. International as well as industry experience are considered an asset.

 

Please submit your cover letter, CV, list of publications (please highlight up to 3 with a brief explanation of their impact), your future research plan (3 pages max.) and contact details of three referees as a single PDF via our online submission system until January 24, 2021.

 

A virtual selection symposium including individual interviews is planned for the 8 and 9 February 2021.

 

To promote diversity, we welcome applications from talented people regardless of cultural background, nationality, ethnicity, gender and sexual identity, physical abilities, religion and age. Qualified applicants with physical disabilities will be given preference.

Curious? Questions? Please contact us: Diese E-Mail-Adresse ist vor Spambots geschützt! Zur Anzeige muss JavaScript eingeschaltet sein!    

 

Online application: https://jobs.helmholtz-muenchen.de/z6dkw

 

Helmholtz Zentrum München

Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH)

Helmholtz AI and Helmholtz Pioneer Campus

Ingolstädter Landstraße 1

85764 Neuherberg

 

“Helmholtz Munich is a certified equal opportunity employer with a family-friendly research environment, dual-career opportunities and child-care facility on Campus that warmly welcomes applications from female scientists.”

“The Helmholtz Zentrum München is part of the Helmholtz Association, Germany's largest scientific organization. Altogether 40 000 people currently work in its 19 scientific-technical and biological-medical research centers. The Association's annual budget amounts to around 4.7 billion Euros.”

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