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Wissenschaftliche Mitarbeiterin/Mitarbeiter („Doktorandenstelle“) E13 TV-L, 65 %

Am Institut für Bioinformatik der Universitätsmedizin Greifswald ist eine befristete Stelle über 3 Jahre zu dem Thema „ML approaches for integrative Multi-Omics“ zu besetzen. Das Projekt umfasst die Analyse von „Single-Cell Sequencing“, „Microbiome“ und „Mutational Signatures“ in Transkriptom- und Genom-Datensätzen. Neben der Auswertung von Hochdurchsatz-Datensätzen und deren Normalisierung geht es auch um Post-Hoc Analysen zur funktionellen Analyse und Identifizierung von Markergenen und deren Verknüpfung zu klinischen Daten und Umwelteinflüssen. Hierbei ist die Anwendung verschiedener Analysetools und deren Visualisierung und Aufbereitung ein Schwerpunkt. 

Ihre Aufgaben:

• Analyse von Single-Cell Sequencing Datensätzen

• Analyse von Microbiom Datensätzen

• Analyse von Regulatorischen Zusammenhängen on Transkriptom und Genomischen Signaturen

• Anwendung und Erstellung von R und Python Skripten zur Analyse und statistischen Auswertung

• Gene Set Enrichment und Pathway-Analysen

Unsere Anforderungen:

• Umgang mit Next Generation Sequencing Datensätzen (im besten Falle „Single-Cell Sequencing“)

• Übung in der Programmierung mit R und/oder Python

• Erfahrung in statistischer Auswertung

• Selbständiges Erarbeiten biologischer Hypothesen und Fragestellungen

• Erste Erfahrungen mit Maschinellen Lernmethoden

• abgeschlossenes Studium (Diplom oder Master) in Bioinformatik oder einem verwandten Studiengang

 

Aussagekräftige Bewerbungen mit allen relevanten Unterlagen bitte per E-Mail bis zum 10.12.2021 an Herrn Prof. Dr. Stefan Simm, Universitätsmedizin Greifswald, Institut für Bioinformatik (E-Mail bitte an das Sekretariat: bioinformatik{at}uni-greifswald.de oder persönlich: stefan.simm{at}uni-greifswald.de). 

Adresse: Center for functional Genomics of Microbes, Felix-Hausdorff-Str. 8, 17475 Greifswald 

 

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