| M.Sc. Angewandte Informatik (Universität Bayreuth) | Bayreuth | Universität Bayreuth | Vertiefung |
| M.Sc. Bioinformatik (Freie Universität Berlin) | Berlin | Freie Universität Berlin | Hauptfach |
| M.Sc. Bioinformatik und Genomforschung (Universität Bielefeld) | Bielefeld | Universität Bielefeld | Hauptfach |
| M.Sc. Naturwissenschaftliche Informatik (Universität Bielefeld) | Bielefeld | Universität Bielefeld | Hauptfach |
| M.Sc. Biologie (Technische Universität Braunschweig) | Braunschweig | Technische Universität Braunschweig | Wahlpflicht |
| M.Sc. Biotechnologie (Technische Universität Braunschweig) | Braunschweig | Technische Universität Braunschweig | Wahlpflicht |
| M.Sc. Biotechnologie (Hochschule Bremerhaven) | Bremerhaven | Hochschule Bremerhaven | Wahlpflicht |
| M.Sc. Life Science Informatics (Technische Hochschule Deggendorf) | Deggendorf | Technische Hochschule Deggendorf | Hauptfach |
| M.Sc. Molecular Bioengineering (Technische Universität Dresden) | Dresden | Technische Universität Dresden | Teilbereich |
| M.Sc. Informatik (Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf) | Düsseldorf | Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf | Vertiefung |
| M.Sc. Biologie (Universität Duisburg-Essen) | Essen | Universität Duisburg-Essen | Wahlpflicht |
| M.Sc. Medizinische Biologie (Universität Duisburg-Essen) | Essen | Universität Duisburg-Essen | Wahlpflicht |
| M.Sc. Bioinformatik (Goethe-Universität Frankfurt a.M.) | Frankfurt a.M. | Goethe-Universität Frankfurt a.M. | Hauptfach |
| M.Sc. Bioinformatik und Systembiologie (Technische Hochschule Mittelhessen in Kooperation mit Justus-Liebig-Universität Gießen) | Gießen | Technische Hochschule Mittelhessen | Hauptfach |
| M.Sc. Angewandte Informatik (Georg-August-Universität Göttingen) | Göttingen | Georg-August-Universität Göttingen | Studienrichtung |
| M.Sc. Angewandte Statistik (Georg-August-Universität Göttingen) | Göttingen | Georg-August-Universität Göttingen | Studienrichtung |
| M.Sc. Biomathematik (Universität Greifswald) | Greifswald | Universität Greifswald | Verwandtes Fachgebiet |
| M.Sc. Bioinformatik (Martin-Luther Universität Halle-Wittenberg) | Halle | Martin-Luther Universität Halle-Wittenberg | Hauptfach |
| M.Sc. Bioinformatik (Universität Hamburg) | Hamburg | Universität Hamburg | Hauptfach |
| M.Sc. Life Science (Leibniz Universität Hannover) | Hannover | Leibniz Universität Hannover | Teilbereich |
| M.Sc. Molekulare Biotechnologie (Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg) | Heidelberg | Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg | Vertiefung |
| M.Sc. Bioinformatik (Friedrich-Schiller-Universität Jena) | Jena | Friedrich-Schiller-Universität Jena | Hauptfach |
| M.Sc. Bioinformatik (Universität Leipzig) | Leipzig | Universität Leipzig | Hauptfach |
| M.Sc. Informatik (Universität zu Lübeck) | Lübeck | Universität zu Lübeck | Vertiefung |
| M.Sc. Mathematik in Medizin und Lebenswissenschaften (Universität zu Lübeck) | Lübeck | Universität zu Lübeck | Verwandtes Fachgebiet |
| M.Sc. Angewandte Bioinformatik (Johannes Gutenberg Universität Mainz) | Mainz | Johannes Gutenberg Universität Mainz | Hauptfach |
| M.Sc. Informatik (Philipps Universität Marburg) | Marburg | Philipps Universität Marburg | Vertiefung |
| M.Sc. Bioinformatik ( Ludwig-Maximilians-Universität München & Technische Universität München) | München | Ludwig-Maximilians-Universität München & Technische Universität München | Hauptfach |
| M.Sc. Molekulare Biotechnologie (Wissenschaftszentrum Weihenstephan, TU München) | München | Technischen Universität München | Vertiefung |
| M.Sc. Biowissenschaften (Westfälische Wilhelms-Universität Münster) | Münster | Westfälische Wilhelms-Universität Münster | Wahlpflicht |
| M.Sc. Bioinformatik (Universität Potsdam) | Potsdam | Universität Potsdam | Hauptfach |
| M.Sc. Computational Science (Universität Regensburg) | Regensburg | Universität Regensburg | Hauptfach |
| M.Sc. Bioinformatik (Universität des Saarlands) | Saarbrücken | Universität des Saarlands | Hauptfach |
| M.Sc. Bioinformatik (Eberhard Karls Universität Tübingen) | Tübingen | Eberhard Karls Universität Tübingen | Hauptfach |
| M.Sc. Biosystemtechnik/Bioinformatik (Technische Hochschule Wildau) | Wildau | Technische Hochschule Wildau | Hauptfach |
