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Job Offers

W2-Professur (m/w/d) Angewandte Bioinformatik [Hochschule Coburg]

Sie sind eine wissenschaftlich ausgewiesene Persönlichkeit mit einschlägiger Expertise in der Bioinformatik und Anwendungs-erfahrung in den Biowissenschaften. In der Lehre sollen die Bereiche der Datenanalyse und -management, Data Mining und Statistik in einem bioanalytischen Kontext vermittelt werden. In der Forschung ergänzen Sie die Expertise des Instituts für Bioanalytik (IBICO).

Wir sind ein engagiertes Team in einer forschungsstarken, national und international vernetzten Fakultät, das in kollegialer und fakultätsübergreifender Zusammenarbeit unser zukunftsweisendes Studienangebot ständig weiterentwickelt.

Sie haben Freude daran, auch in englischer Sprache, Forschung und Lehre in inspirierenden didaktischen Formaten zu verknüpfen?

Wir bieten mit dem IBICO eine hervorragend ausgestattete Infrastruktur für industrieorientierte, drittmittelfinanzierte Forschung.

Sie reizt es, Ihre anwendungsorientierte Erfahrung einzubringen, um das IBICO durch Ausbau des Projektportfolios regional/international weiterzuentwickeln und zu stärken?

Dann freuen wir uns über Ihre Bewerbung auf die ausgeschriebene Stelle!

 

An der Hochschule Coburg können Sie:

 

  • Lehre, Forschung und Transfer innovativ verknüpfen,
  • mit Kolleg*innen aus unterschiedlichen Fachdisziplinen an zukunftsrelevanten Themen arbeiten,
  • junge Menschen auf die Berufswelt von morgen vorzubereiten .

    Die Stadt Coburg als Kultur- und Familienstadt und die Genussregion Oberfranken bieten die besten Voraussetzungen für hohe Lebensqualität.

    Die Hochschule fördert ein verstärktes Engagement bei Projekten der angewandten Forschung sowie im Wissens- und Technolo-gietransfer. Die aktive Mitgestaltung der Bioanalytikstudiengänge und weiterer Studiengangskonzepte wird vorausgesetzt. Ebenso sind Aufgaben in der Selbstverwaltung der Hochschule wahrzunehmen.

 

Einstellungsvoraussetzungen:

 

  • Abgeschlossenes Hochschulstudium, vorzugsweise in der Bioinformatik oder in verwandten Disziplinen
  • Pädagogische Eignung; der Nachweis hierzu ist u.a. durch eine Probelehrveranstaltung zu erbringen
  • Besondere Befähigung zu wissenschaftlicher Arbeit, die durch eine Promotion oder promotionsadäquate Leistungen nach-gewiesen wird
  • Besondere Leistungen bei der Anwendung oder Entwicklung wissenschaftlicher Erkenntnisse und Methoden in einer mindestens fünfjährigen beruflichen Praxis, die nach Ab-schluss des Hochschulstudiums erworben sein muss und von der mindestens drei Jahre außerhalb des Hochschulbereichs ausgeübt worden sein müssen. Der Nachweis der außerhalb des Hochschulbereichs ausgeübten beruflichen Praxis kann in besonderen Fällen dadurch erfolgen, dass über einen Zeitraum von mindestens fünf Jahren ein erheblicher Teil der beruflichen Tätigkeit in Kooperation zwischen Hochschule und außerhochschulischer beruflicher Praxis erbracht wurde.
  • Es ist beabsichtigt, Sie bei Vorliegen der beamtenrechtlichen Voraussetzungen in ein Beamtenverhältnis auf Probe/Lebenszeit zu berufen. In das Beamtenverhältnis kann berufen werden, wer das 52. Lebensjahr noch nicht vollendet hat.

 

Bewerbungen von schwerbehinderten Menschen im Sinne des § 2 i.V.m. § 68 SGB IX werden bei sonst im Wesentlichen gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung bevorzugt.

 

Die Hochschule Coburg hat sich die berufliche Förderung von Frauen zum Ziel gesetzt und begrüßt deshalb ausdrücklich Bewerbungen von Frauen.

 

Ansprechpartner

 

Auskünfte zur Ausschreibung können über das Sekretariat der Fakultät Angewandte Naturwissenschaften Tel. 09561 317-283 bzw. bei Prof. Dr. habil. Matthias Noll, Tel. 09561 317-645, E-Mail: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. eingeholt werden.

 

Bewerbungsfrist

 

09.07.2020

 

Weitere Stellenangebote

 

www.hs-coburg.de/stellenangebote

 

 

 

Links: https://stellenangebote.hs-coburg.de/jobposting/5fd78f5f58c2dd28e89b1f550f38f61ce8ceef2f0?ref=homepage

 

 

Bioinformatician on Genomics of Ageing

The Institute of Molecular Biology gGmbH

 

funded by the Boehringer Ingelheim Foundation

 

is recruiting a

Bioinformatician on Genomics of Ageing

(m/f/d)
(#CFBIO15)

 

 

The Institute of Molecular Biology (IMB) is a Centre of Excellence for Life Sciences, funded by the Boehringer Ingelheim Foundation, and located at the campus of the Johannes Gutenberg University in Mainz, Germany. The Bioinformatics Core Facility supports IMB researchers in the computational analysis of NGS and other “omics” data generated in the course of research projects. We are looking for a highly motivated Bioinformatician (m/f/d) to join our Core Facility team and establish a platform for analysis of biological ageing using diverse omics datasets.

 

You will:

·         Support biomedical scientists in Mainz in the planning, analysis, interpretation and publication of diverse NGS and other omics data sets in the context of aging research

·         Contribute to the development of bioinformatics workflows and pipelines

·         Provide bioinformatics consulting and software training to junior researchers

 

Required qualifications:

·         University degree or postgraduate training in computational biology / bioinformatics

·         Extensive and broad experience in the computational analysis of omics data

·         Solid programming skills and familiarity with Linux compute clusters

·         Sound knowledge of statistics, version control and R / Bioconductor

·         Strong interpersonal and communication skills, proficiency in English

 

Desirable qualifications:

·         Knowledge of software engineering and bioinformatics pipelines

·         Experience in interdisciplinary collaborations or bioinformatics services

 

We offer:

·         Stimulating, diverse and international research environment

·         Flexible working hours and advanced training opportunities

·         Favourable pension scheme

 

To apply, please send a single PDF file containing your cover letter, CV, certificates and contact information of at least two professional references quoting Ref. No. CFBIO15 to This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.. IMB is an equal opportunity employer.

 

Starting Date:  as soon as possible

Duration:   initial contract for two years with an option for permanent employment

Application  Deadline:  September 1st 2020

Declaration of Consent and Data Protection

By sending us your application, you are consenting to us saving your personal data in order to carry out the selection process. You can find more information on data protection and retention periods at https://www.imb.de/jobs/data-protection.

Research Associates at the CDCS

The Center for Data and Computing in Natural Science (CDCS) is a new scientific institution formed as a partnership between the University of Hamburg, the Deutsche Elektronen-Synchrotron DESY and the Hamburg University of Technology. The CDCS is dedicated to the development and application of modern information technologies (Data Science, Artificial Intelligence, Scientific Computing) to complex scientific questions. With modern organisational concepts (so-called Cross-Disciplinary Labs) a flexible structure is created, which works integrative between the scientific groups of computer science and natural science.

The Center for Data and Computing in Natural Sciences (MIN Faculty) which is currently being formed invites applications for several

RESEARCH ASSOCIATES

The positions in accordance with Section 28 subsection 3 of the Hamburg higher education act (Hamburgisches Hochschulgesetz, HmbHG) commence on September 1, 2020.
A total of 11 postdoctoral positions will be filled in the CDCS, 3 of which will be in the Informatics Core Unit and 2 in each of the four thematic Cross-Disciplinary Labs. The thematic priorities of the CDLs are Astro- and Particle Physics (1), Photon Science (2), Systems Biology (3) and Control of Accelerators (4). The detailed job descriptions can be found on our website: https://uhh.de/cdcs-jobs

 

Scientific Researcher (f/m/x) Bioinformatics at the University Clinic Cologne

The Institute for Virology (Director: Univ.-Prof. Dr. Florian Klein) specializes in diagnostics and research pertaining to human pathogenic viruses. We apply a wide spectrum of molecular biological and bioinformatic techniques. Research topics include the identification and assessment of the development of viral resistance as well as research on new vaccination and therapeutic strategies. In collaboration with the Max Planck Institute for Informatics in Saarbrücken we have developed algorithms and implemented software (geno2pheno) that is used internationally and facilitates bioinformatic analyses of viral resistance for HIV as well as the hepatitis C and hepatitis B viruses. Together with Prof. Dr. Thomas Lengauer, who directed the development of the server and who is currently affiliated with our Institute we are continuing our research on the respective methods and applications. Furthermore we are extending our research to bacterial infections and cancer.
Your tasks:

  • Research on bioinformatic methods for processing and analyzing comprehensive genomic and clinical datasets (viral and bacterial infections)
  • Development, implementation and application of corresponding software
  • Support of porting the geno2pheno server from Saarbrücken to the University of Cologne and advancing the respective methods and software

Your Profile:

  • Master oder PhD in bioinformatics/computational biology, biostatistics, computer science or a closely relatedfield
  • Profound knowledge and experience with methods of statistics and statistical learning
  • Profound knowledge and experience with programming languages and environments (e.g. R, Python, C++,Perl, Java, Javascript; Oracle, Webserver), to be documented via central contributions to larger programming projects (programming experience within curricular courses or practicals is not sufficient)  
  • Proactive team player with excellent communication and writing skills

We offer:

  • A research environment that offers exciting and diverse opportunities
  • Flexible working hours
  • Perspectives for further scientific qualification
  • You will work in a highly interdisciplinary environment that is internationally excellently interconnected and provides opportunities for innovative research on patient-related and medically highly relevant topics. Collaboration with research groups in medicine, computational biology and computer science at Cologne University are existing or available. Your research will uniquely combine basic research on computational methods with medical applications. Perspectives for scientific advancement towards PhD or beyond are included in the profile of the position

Your salary will be based on TV-L, the position is time-limited (3 years).
Please supply the usual application materials incl. CV, documents and transcripts, publication list, research statement (detailed description of previous experiences in research and programming as well as sketch of research perspectives) and names of two references, here online. Applicatons should preferably be made online via https://jobs-uk-koeln.de/index.php?ac=jobad&id=1418 (click on the blue button at the bottom of the page). You can also apply via email to This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it..

Bioinformatics Engineer

Platomics develops a global marketplace for personalized medicine to make the future of molecular diagnostics available today. We are a young vibrant team and apply the most advanced computing technologies to enable big data processing and analysis in healthcare. Our backgrounds are in bioinformatics, genetics, software development, and mathematics. As a Bioinformatics Developer you will work at the core of the Platomics team where you have the opportunity to directly influence the way how personalize medicine is going to impact the future.

 

As a Bioinformatics Developer you have the following responsibilities:

  • Design and implementation of bioinformatics-based solutions for personalized medicine
  • Development of data-driven applications
  • Design and implementation of highly scalable, cloud-based microservices
  • Development of highly stable and well documented code for a medical application

 

Required qualifications:

  • University degree with focus on a computational discipline (Bioinformatics, Physics, Computational Chemistry, Computer Science, ...)
  • Professional development experience with Python
  • Enthusiasm to work in an interdisciplinary team
  • Not afraid of complex problems

 

Nice-to-haves:

  • Domain knowledge in Bioinformatics and Next Generation Sequencing
  • Familiarity with Molecular Biology or Medical Applications of NGS
  • Knowledge of Docker and Kubernetes
  • Hands-on experience with design of Microservices
  • Development experience with CUDA
  • Knowledge of machine learning frameworks (PyTorch, Keras, Tensorflow, ...)
  • Familiarity with agile software development
  • Experience with GitLab CI/CD pipelines
  • Proficiency in Linux and bash

 

 

We offer:

  • An interdisciplinary and dedicated team
  • Exciting challenges in a fast-evolving domain
  • Opportunity to work on cutting-edge technologies
  • A flexible work schedule
  • Convenient office location close to U1, U2 and U4 metro station Karlsplatz in Vienna

 

 

You’ll earn an appropriate salary starting at EUR 58.000 gross. Willingness for over-payment is given for candidates with proper experience and/or qualifications.

 

If you are interested in strengthening our development team please e-mail your CV, optionally including your GitHub/Kaggle/Datacamp profiles, to our HR department at This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

 

(Karlskirche) in the 4th district of Vienna.

 

Apply via: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. or call +43 660 222 03 95]

 

 

Links: https://www.platomics.com/bioinformatics-developer

(Bio‑)Informatikerin / (Bio‑)Informatiker (m/w/d) für Proteomics und cloud-Anwendungen

Kategorie

Wissenschaftl. Mitarbeiter(in)

Beschreibung

Die Ruhr-Universität Bochum (RUB) ist eine der führenden Forschungsuniversitäten in Deutschland. Als reformorientierte Campusuniversität vereint sie in einzigartiger Weise die gesamte Spannbreite der großen Wissenschaftsbereiche an einem Ort. Das dynamische Miteinander von Fächern und Fächerkulturen bietet den Forschenden wie den Studierenden gleichermaßen besondere Chancen zur interdisziplinären Zusammenarbeit.

Die Medizinische Bioinformatik sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt:

eine (Bio‑)Informatikerin / einen (Bio‑)Informatiker (m/w/d).

Die Medizinische Bioinformatik des Medizinischen Proteom-Centers (MPC) realisiert unter anderem das BMBF-drittmittelgeförderte Service-Center "Bioinformatik der Proteomik - BioInfra.Prot" des Deutschen Netzwerks für Bioinformatik Infrastruktur (www.denbi.de) und ist beteiligt am Europäischen Proteinforschungskonsortium PURE (http://www.pure.rub.de/) sowie an einem DGUV-geförderten Projekt zur Verifizierung von neuen molekularen Markern für die Frühdiagnose asbestassoziierter Lungentumoren.

Tätigkeiten:

    • Entwickeln neuer Algorithmen aus dem Bereich "Bioinformatik der Proteomik" und Implementierung dieser in wissenschaftliche Auswerte-Software

    • Auswertung proteomischer Daten

    • Unterstützung von Wissenschaftlern bei der Auswertung proteomischer Daten und der Anwendung von Auswerte-Software

    • Anpassen / Weiterentwickeln von wissenschaftlicher Auswerte-Software aus dem Bereich “Bioinformatik der Proteomik” für die Benutzung in cloud-Infrastrukturen (z. B. de.NBI-cloud)

    • Unterstützung bei der Etablierung der wissenschaftlichen cloud -Infrastruktur

 

Anforderungsprofil

Sie haben Kenntnisse und / oder Erfahrungen in den folgenden Bereichen der Informatik / Bioinformatik:

    • Abgeschlossenes Studium der (Bio-)Informatik oder vergleichbarem Studiengang (Master oder Diplom)

    • Administration von Linux-Betriebssystemen, Linux-Skript-Programmierung

    • Objektorientierte Programmierung (z. B. Python, Java, C++)

 

Wünschenswert sind Kenntnisse und Interesse an:

    • Verteiltes Rechnen und/oder Virtualisierung und Containerization

    • Bioinformatik-Algorithmen, Bioinformatik der Proteomik

    • Auswertung biologischer Hochdurchsatz- / Omics-Daten

    • Administration von Windows-Betriebssystemen

    • OpenStack

Erfolgt die Finanzierung bei der Einstellung ausschließlich von externen Drittmittelgebern, besteht für die Beschäftigten keine Verpflichtung zur Übernahme von Lehrverpflichtung.

Wir wollen an der Ruhr-Universität Bochum besonders die Karrieren von Frauen in den Bereichen, in denen sie unterrepräsentiert sind, fördern und freuen uns daher sehr über Bewerberinnen. Auch die Bewerbungen geeigneter schwerbehinderter und gleichgestellter Bewerber und Bewerberinnen sind herzlich willkommen. Fahrtkosten für evtl. Bewerbungsgespräche können nicht erstattet werden. Die Rücksendung von Bewerbungsunterlagen kann nur erfolgen, wenn ein adressierter und frankierter Rückumschlag beigefügt wird.

 

Kontaktdaten

Ansprechpartner

Herr Dr. Markus Stepath

Einsatzort

Gesundheitscampus

4

44801 Bochum

Deutschland

Telefon

+49 234 32 18111

E-Mail

This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

Art der Beschäftigung

Vollzeit

Weitere Informationen

Institut / Einrichtung

Medizinisches Proteom-Center

Zeitraum der Beschäftigung

nächstmöglicher Zeitpunkt bis 31.12.2021

Bewerbungsfristende

Donnerstag, 21. Mai 2020 - 23:59

Vergütung

TV-L E13 (100%)

 

Das Institut für Medizinische Bioinformatik der Universitätsmedizin Göttingen sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt: Wissenschaftlicher Mitarbeiter (m/w/d) für eine Promotionsarbeit im Schnittstellenbereich translationale Onkologie und Bioinformatik

 Das Institut für Medizinische Bioinformatik der Universitätsmedizin Göttingen sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt:

Wissenschaftlicher Mitarbeiter (m/w/d) für eine Promotionsarbeit

im Schnittstellenbereich translationale Onkologie und Bioinformatik

befristet auf drei Jahre, Teilzeit (65%), Entgelt nach TV-L

Als Teil des Comprehensive Cancer Center (CCC) wird zurzeit an der Universitätsmedizin Göttingen (UMG) ein Molekulares Tumor Board (MTB) eingerichtet, in dem in Tumoren genetische Alterationen als Basis für eine zielgerichtete Tumortherapie identifiziert werden sollen. Dazu werden Methoden, Software und Wissensdatenbanken zur Bewertung genetischer Veränderungen in Tumoren und zur Vorhersage und Bewertung von personalisierten Behandlungsmöglichkeiten benötigt. Es werden bioinformatische Werkzeuge, lokale Wissensdatenbanken und Ontologien entwickelt, um in Zusammenspiel mit Weltwissen und existierenden Tools patientenspezifische Therapieoptionen für die Onkologen aufzubereiten. Hierfür ist das Team interdisziplinär aufgebaut und umfasst an der Universitätsmedizin Göttingen das Institut für Medizinische Bioinformatik, die Klinik für Onkologie und das Institut für Medizininformatik.  Zusätzliche Kooperationspartner sind das Institut für Pathologie der UMG sowie das Westdeutsche Tumorzentrum in Münster und das Deutsche Krebsforschungszentrum.

 

Ihre Aufgaben:

·        Unterstützung des Projekts an der Schnittstelle zwischen Tumorgenetik, Bioinformatik und praktischer Anwendung in der klinischen Onkologie

·        Aufarbeitung von Daten aus dem Molekularen Tumor Board zur Schaffung eines lokalen Repositoriums

·        Mitarbeit bei der Entwicklung von Methoden zur Unterstützung der Vorbereitung des molekularen Tumorboards

·        Vereinheitlichung und Interpretation von Daten für die Annotation mit selbst entwickelten Ontologien

·        Aufbau eines Wissensrepositoriums zur Speicherung des Wissens von lokalen Experten und Ergebnissen des molekularen Tumorboards

 

Ihr Profil:

·        abgeschlossenes Hochschulstudium in molekularer Medizin, Biologie, Humanmedizin, Bioinformatik oder einem vergleichbaren Studiengang

·        Grundverständnis über Tumorerkrankungen und Tumorgenetik

·        idealerweise Erfahrungen aus wissenschaftlichen Projekten oder Initiativen

·        Interesse an dem Lösen von biomedizinischen Fragestellungen mit bioinformatischen Methoden, möglichst bereits Programmiererfahrung in z. B. R, Python oder Java

·        Interesse an interdisziplinären Arbeiten und Neugier auf Herausforderungen außerhalb Ihres ursprünglichen Fachgebiets

·        einen Blick für das Ganze und Interesse an der Entwicklung eines nachhaltigen Ergebnisses

·        Englisch und Deutsch flüssig in Wort und Schrift

 

Bei Rückfragen geben Ihnen Dr. Raphael Koch und Dr. Jürgen Dönitz (This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.ngen) Auskunft.

 

Die Universitätsmedizin Göttingen strebt in den Bereichen, in denen Frauen unterrepräsentiert sind, eine Erhöhung des Frauenanteils an und fordert daher qualifizierte Frauen ausdrücklich zur Bewerbung auf.

Der beruflichen Teilhabe von schwerbehinderten Menschen sieht sich die Universitätsmedizin Göttingen in besonderer Weise verpflichtet und begrüßt deshalb Bewerbungen schwerbehinderter Menschen. Bei gleicher Eignung werden Bewerbungen schwerbehinderter Personen nach Maßgabe der einschlägigen Vorschriften bevorzugt berücksichtigt. Wir bitten Sie, eine Behinderung/ Gleichstellung zur Wahrung Ihrer Interessen bereits im Bewerbungsschreiben anzugeben.

 

Ihre Bewerbung richten Sie bitte bis zum 17.05.2020 ab:

Universitätsmedizin Göttingen

Institut für Medizinische Bioinformatik

Prof. Dr. Tim Beißbarth

Institutsleiter

Goldschmitdtstr. 1

 

37077 Göttingen

Plant bioinf MSc/PhD pos, CEPLAS Grad School Cologne/Düsseldorf

The CEPLAS Graduate School leads students with a Bachelor degree to a fully funded MSc/PhD degree, via a 1-year qualification phase (structured course program) followed by a 3-4 year research phase in a CEPLAS laboratory.

Links: 

https://www.ceplas.eu/fileadmin/user_upload/Training-and-Careers/Graduate_School/Call2020_CEPLAS_GradSchool.pdf

https://www.ceplas.eu/en/training-careers/ceplas-graduate-school/

PhD Student in Computational Biology [Computational Biology of Infection Research at the HZI]

The Department of Computational Biology of Infection Research at the HZI, led by Prof Dr Alice C. McHardy, is looking for a PhD student in computational biology and encourages unsolicited applications.

The PhD student will work in the context of the project “Paving the way towards individualized vaccination (i.Vacc) - Exploring multi-omics Big Data in the general population based on a digital mHealth cohort”.

The goal of our projects is the development of algorithms and computer-aided methods for personalized infection medicine, particularly clinical metaomics, vaccine and drug design, as well as development of core technologies for meta- and other omics analyses. The methods that we develop make use of concepts from machine learning, phylogenetics and population genetics. The lab co-organizes the Critical Assessment of Metagenome Interpretation challenge, hosts the bioinformatics unit of the German Center for Infection Research, and is well connected to local, national and international partners from medicine, biology and computer science. Notably, the lab is part of the Cluster of Excellence RESIST funded by Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG), carrying out research on infections in order to specifically help people, for whom disease-causing viruses and bacteria are particularly dangerous.

Requirements: The candidate should have a master’s degree in bioinformatics, biomathematics, computer science, statistics or similar. A commitment to reproducible research, the ability to work in a highly interdisciplinary research field and good programming skills are obligatory. Prior experience in meta’omics, infection research, statistical learning or with the analysis of NGS data sets is advantageous, but not required.

What we offer: In our lab, you will work with an international and highly motivated team. You will have the opportunity to attend and present your work on international scientific conferences. Furthermore, the position offers remuneration and social benefits according to TvöD with a fixed-term contract for 3 years.

Location: Braunschweig (Germany)
Starting date: As soon as possible; initial contract for 3 years with possible extensions depending on project development
Probation period: 6 months
Salary: TVöD E13, 75% (~38.000 € pre-tax)

The lab is part of the Helmholtz Center for Infection Research, the Braunschweig Integrated Center for System Biology (BRICS) and Technical University of Braunschweig, Germany. The Helmholtz society is the largest research organization in Germany and ranked 7th among the research institutions in the world. Braunschweig is a centrally located city in Germany, with many scientific institutions, recreational areas, comparably modest costs of living and about 250.000 residents.

Application

Please find here the contact details for Prof. Alice McHardy or Lorina Reinhardt for further questions.

Equal Opportunities

Qualified applicants with a disability will be given preference. Qualified women are especially invited to apply.

Please send your electronic application materials including a letter of motivation, curriculum vitae, copies of your publications if applicable and addresses of two or three referees referring to code i.Vacc/PhD/2020 by E-Mail to:

This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

Postdoc in Computational Biology [Computational Biology of Infection Research at the HZI ]

The Department of Computational Biology of Infection Research at the HZI, led by Prof Dr Alice C. McHardy, is looking for excellent postdocs in computational biology and encourages unsolicited applications.

The goal of our projects is the development of algorithms and computer-aided methods for personalized infection medicine, particularly clinical metaomics, vaccine and drug design, as well as development of core technologies for meta- and other omics analyses. The methods that we develop make use of concepts from machine learning, phylogenetics and population genetics. The lab co-organizes the Critical Assessment of Metagenome Interpretation challenge, hosts the bioinformatics unit of the German Center for Infection Research, and is well connected to local, national and international partners from medicine, biology and computer science. The lab’s projects offer plenty of opportunity for an excellent bioinformatics postdoc to shine.

Requirements: The candidate should have a PhD degree in bioinformatics, machine learning, biomathematics, computer science, statistics or similar and a competitive publication record. A commitment to reproducible research, the ability to work in a highly interdisciplinary research field and very good programming skills are obligatory. Prior experience in meta’omics, infection research, statistical learning or with the analysis of NGS data sets is advantageous, but not required.

Location: Braunschweig (Germany)

Starting date: As soon as possible; initial contract for 2 years with possible extensions depending on performance

Probation period: 6 months

Salary: TVöD E13.2 – E14.2 (~54.000 € – 63.000 € pre-tax, depending on qualifications)

The lab is part of the Helmholtz Center for Infection Research, the Braunschweig Integrated Center for System Biology (BRICS) and Technical University of Braunschweig, Germany. The Helmholtz society is the largest research organization in Germany and ranked 7th among the research institutions in the world. Braunschweig is a centrally located city in Germany, with many scientific institutions, recreational areas, comparably modest costs of living and about 250.000 residents.

Application

Please find here the contact details for Prof. Alice McHardy or Lorina Reinhardt for further questions.

Equal Opportunities

Qualified applicants with a disability will be given preference. Qualified women are especially invited to apply.

Please send your electronic application materials including a letter of motivation, curriculum vitae, copies of your most important publications and addresses of two or three referees referring to code PD/2020 by E-Mail to:

This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

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